Στα νερά του Αμβρακικού ζουν πολλά ψάρια αλλά και σπάνια είδη πουλιών. Ο Αμβρακικός κόλπος περικλείεται από εύφορες πεδιάδες γύρω στις οποίες υπάρχουν σπουδαίες καλλιέργειες από τα αρχαία χρόνια. Στις αίθουσες του μουσείου γίνεται πλήρης ενημέρωση για όλο το οικοσύστημα της περιοχής.